基础医学学科形成于1937年，基础医学院面向所有医学专业以及医学相关专业5年制、7年制本科生、侯宗濂医学实验班（8年）、医学研究生以及留学生开设课程15门，包括人体解剖学、组织胚胎学、病原微生物学、寄生虫学、免疫学、病理学、病理生理学、生理学、生物化学、分子生物学、医学遗传学、细胞生物学、神经生物学以及机能实验学以及药理学。除部分新开设课程之外，其余全部为陕西省精品课程；学院拥有国家级优秀教学团队2个（生理学、药理学），国家级精品课程1门（生理学），国家双语示范课程1门（药理学），精品资源公开课1门（生理学），陕西省实验教学示范中心1个；2013年获得国家级教学成果二等奖1项，陕西省教学成果二等奖1项；作为主编或副主编编写了包括《生理学》、《局部解剖学》、《药理学》、《机能实验学》和临床医学专业“器官-系统”整合课程与PBL教学系列教材在内的多部基础课程国家级规划教材；除此之外，PBL教学以及MOOC、微课、翻转课堂等多种教学模式被成功引入教学过程。

在研究生培养方面，分别于1979年、1981年获国务院学位委员会首批硕士、博士学位授予权，目前，基础医学院所有二级学科均为硕士、博士学位授予权点（基础医学7个二级学科、生物学5个二级学科、药学1个二级学科药理学）。另于2000年获得基础医学一级学科博士学位授 权点和 博士后流动站，分别于2007年、2010年获生物学一级学科博士学位授 权点和 博士后流动站。

教育教学是学院的中心工作，为各类医学人才的培养奠定了坚实的基础。