人体解剖与组织胚胎学：中枢神经系统退行性疾病发病机制及其防治研究；结缔组织细胞代谢和代谢疾病的分子机制；干细胞多能性维持与定向分化调控机制。
免疫学：免疫细胞分化与免疫相关疾病的机制、T细胞与肿瘤、自身免疫性疾病发病机制与治疗、B细胞发育和B细胞肿瘤发生机制及靶向治疗、神经系统疾病发生的免疫机制、天然免疫与肿瘤免疫学机制、疫苗免疫应答与免疫调控。
生物学：病原菌的耐药与致病机制及防治；病毒感染与致病机理；寄生虫感染致病机制；感染免疫。
病理学与病理生理学：生殖疾病病理机制研究；消化、泌尿、生殖系统肿瘤；上皮组织生理与病理研究；动脉瘤的发病机制及其防治研究；心血管疾病实验病理研究。
疫苗与免疫工程(交叉方向)：新型病原体疫苗的研究与开发、肿瘤疫苗的研究与开发、新型佐剂及其他免疫相关生物制剂的研究与开发。
